El MINI Cooper SE es más pesado y más aerodinámico que cualquier otro MINI 3p. Lo primero se debe a la batería de alta tensión. Es de iones de litio de 32,6 kWh de capacidad bruta y 28,9 neta. Está dispuesta en forma de T en la parte baja de la carrocería y no resta espacio en el habitáculo, ni el el maletero. Por su posición, ayuda a reducir el centro de gravedad del vehículo, que está 30 mm más bajo que, por ejemplo, el de un Cooper S.
La batería es la responsable de que el Cooper SE sea más pesado que cualquier otro MINI 3p (pesa 145 kg más que un MINI Cooper S con cambio automático, ficha comparativa). Con todo, no se trata de una batería muy grande. Eso influye en que este MINI pese menos que muchas alternativas. Por ejemplo su masa es 90 kg inferior a la del Peugeot e-208 (340 km de autonomía y su batería tiene una capacidad bruta de 50 kWh) y a la del Opel Corsa-e (337 km de autonomía y 50 kWh de capacidad bruta). El Renault Zoe con batería de 41 kWh utilizables (300 kms de autonomía) pesa 137 kg más (ficha comparativa).
El Cooper SE tiene menor coeficiente aerodinámico (0,30) que cualquier otro MINI 3p. Se debe a que en la parte frontal hay menos entradas de aire y, las que hay, son de menor tamaño. Además, los bajos van casi completamente carenados y hay un difusor posterior más efectivo ya que no hay sistema de escape.
Aunque el coeficiente aerodinámico es favorable si lo comparamos con el de cualquier otro MINI 3p, con la superficie frontal ocurre lo contrario. Se debe a que la batería sobresale unos centímetros por la parte inferior de la carrocería. Para que no esté tan expuesta a posibles golpes, MINI ha tenido que levantar 18 mm la suspensión. A pesar de ese incremento de altura total de la carrocería, la distancia libre al suelo es pequeña: 128 mm, frente a los 143 que tiene cualquier otro MINI 3p.
Los discos de freno delanteros tienen 282 mm de diámetro y sus pinzas son flotantes. Detrás hay discos macizos de 280 mm y pinzas también flotantes.
El motor eléctrico no va apoyado directamente en el chasis. Hay una estructura tubular que hace de nexo entre esas dos piezas. Esta estructura va sujeta a los puntos de apoyo del monocasco por tacos de goma y un brazo pendular. MINI dice que este armazón también sirve para proteger el motor y la caja de transmisión, así como la electrónica de potencia de posibles golpes.
A la salida del motor hay una caja de transmisión de una sola velocidad hacia delante donde también está el diferencial. Por lo tanto, y como es natural, hay dos reducciones de la velocidad de giro del motor eléctrico. Tanto el motor como la transmisión van recubiertos con material insonorizante.
Una particularidad que MINI destaca es que el control electrónico de estabilidad tiene un ajuste específico, diferente al de otras versiones, ya que el módulo de control está alojado dentro del sistema propulsor y no externamente, lo que hace que gestione de forma más precisa la capacidad de tracción disponible.
La batería de 12 voltios también está situada bajo el capó, alojada en un cajetín.