El espacio interior para los ocupantes es similar al de la berlina, pero con algunas diferencias. Tiene más altura libre al techo, de hecho, el Clase E Estate es uno de los familiares, que hemos medido, que más destaca en ese aspecto (mediciones interiores). Hay ligeramente menos espacio para las piernas de los ocupantes traseros, ya que la banqueta va colocada más cerca del suelo y más cerca de las plazas delanteras que en la berlina.

Aunque tiene mucha anchura en las plazas traseras, tres adultos no pueden viajar con comodidad en viajes largos. La plaza central no es cómoda porque el mullido del respaldo y, en menor medida, de la banqueta es duro y no sujeta bien el cuerpo. A diferencia del Clase E Berlina, el Estate no se puede pedir con dos asientos independientes detrás (imagen).

Por lo demás, las impresiones del interior del Clase E Berlina, salvo las referidas al maletero, son válidas para esta versión familiar (más información).

El Estate tiene un maletero de 695 l, 155 l más que las versiones con carrocería de cuatro puertas y 5 l mayor que el del Clase E Estate anterior. En este volumen, está incluido el hueco de 132 l que hay bajo el piso del maletero (destinado a la rueda de repuesto).

Es el familiar con mayor volumen de maletero. Tanto el Serie 5 Touring (500 l) como el A6 Avant (565 l), el 9-5 Wagon (416 l) y el V70 (575 l), entre otros modelos, tienen menos capacidad de carga (listado de turismos familiares de entre 4,75 y 5,00 m ordenado por volumen de maletero).

El maletero es muy aprovechable porque tiene unas formas regulares, el marco del portón está enrasado con el piso del maletero y el borde de carga (la altura mínima que hay que levantar un objeto para introducirlo en el maletero) está a 57 cm del suelo, ligeramente menos que otros modelos similares.

Mide 118 cm de profundidad y 111 cm de anchura. Es 4 cm más profundo y 5 cm menos ancho que el de un Ford Mondeo con carrocería familiar (más información). La altura hasta la cortinilla cubremaletero es 44 cm (sin contar el compartimento bajo el piso). La cortinilla se desplaza eléctricamente por dos raíles y se eleva, casi hasta el techo, cuando se abre el portón, para así facilitar larga y descarga del maletero.

En el interior, tiene dos ganchos para colgar bolsas, dos redecillas y seis argollas para fijar una red de sujeción en el piso del maletero (imagen).

Lleva de serie un sistema de organización de la carga del maletero, denominado «EASY-PACK». Se compone de un par de raíles sobre los que se puede fijar una barrera, para evitar el desplazamiento de la carga (imagen). Sobre estos raíles también puede colocarse una cinta de sujeción, que puede servir -por ejemplo- para asegurar un pequeño bulto. Además, tiene una pequeña caja plegable, que puede resultar muy útil para colocar las bolsas de la compra.

El piso del maletero es plegable y puede colocarse de manera casi vertical en diversas posiciones (imagen), para así evitar que objetos grandes se muevan. Si no se lleva la rueda de repuesto, su hueco puede aprovecharse para transportar objetos voluminosos (imagen).

Puede llegar a tener hasta 1.950 l de capacidad de carga, si se abaten los respaldos de los asientos de las plazas traseras (partidos en secciones). Éstos se pueden plegar individualmente sin necesidad recoger sus reposacabezas. Para ello, hay que accionar unos pulsadores situados en el lateral del maletero (imagen) o junto a las puertas traseras (imagen).

Si el Clase E Estate tiene asientos delanteros eléctricos, también se adelantan ligeramente al accionar estos pulsadores, para así poder colocar más fácilmente una red de seguridad. De tal forma, la cortinilla que cubre el equipaje se puede fijar en el interior del pilar que separa las puertas delanteras y traseras, justo por detrás de los respaldos de los asientos del conductor y el acompañante, a ras del piso. De ella es posible extraer una red de seguridad (imagen) y fijarla al techo, para evitar que algún objeto se desplace y llegue hasta las plazas delanteras.

Para proteger la zona que va desde el final del maletero hasta donde acaba la carrocería (es decir, tanto la zona plateada como el paragolpes -imagen-), de arañazos al cargar o descargar, tiene una cortinilla de unos 25 cm de longitud que se extrae del compartimento del piso del maletero.

El portón del maletero es de apertura eléctrica, tanto si se pulsa un botón del mando a distancia como si se acciona el tirador exterior del portón. Para cerrarlo, hay que pulsar un botón ubicado en el marco del portón. Se puede regular el ángulo de apertura (algo muy útil en garajes con poca altura).